Neku se réveille au milieu du Scramble Crossing animé de Shibuya sans se souvenir de la façon dont il y est arrivé. Il ne sait pas grand-chose, il a été transporté dans un autre plan d’existence connu sous le nom de Underground (UG). Maintenant un participant réticent au mystérieux «jeu des faucheurs», Neku doit s’associer avec une fille nommée Shiki pour survivre. Ensemble, ils accomplissent des missions et vainquent des monstres connus sous le nom de “Noise” en découvrant progressivement la vraie nature de ce jeu tordu.
“Il n’y a qu’une seule façon de rester en vie à Shibuya: faites confiance à votre partenaire.” Vont-ils survivre au jeu des faucheurs?