Afin de lutter contre le crime, la police de Tokyo utilise des robots avancés : les Labors, qui sont aussi utilisés à d’autres fins. Mais le suicide d’un inconnu sur le gigantesque chantier de construction du projet Babylon déclenche une série d’évènements touchant toute la capitale.
Deux officiers de la division mobile de la police, Noah Izumi et Azuma Shinohara, enquêtent en parallèle sur un récent problème de dysfonctionnement sur les Labors causant d’importants dégâts matériels dans la ville. Mais le plus inquiétant reste la découverte d’un virus, nommé Babel, ayant pour but de prendre le contrôle des milliers de Labors en fonctionnement.
