Prenant place après la fin de l’arc Avatar du manga, l’histoire de ce second long-métrage n’est pas centré sur le personnage Natsu Dragneel, mais révèle un point de l’intrigue le concernant.
Le Dragon Cry, sceptre magique lié au cimetière des dragons, a été volé par Zash, premier ministre du royaume de Stella. Celui-ci veut utiliser son pouvoir destructeur pour se venger du royaume de Fiore. L’équipe de Natsu a pour mission de reprendre le sceptre pour l’empêcher de nuire. Mais ils vont découvrir qu’il n’est pas l’objet que d’une seule convoitise…
