La série raconte cette fois encore deux histoires.
La première se projette dans le passé. Yuu Himura rencontre une fille, Yuuko Amamiya, qui semble le connaitre, mais lui ne la connait pas.
Cependant, il se souvient qu’elle est une fille dont il a entendu parler il y a longtemps.
Yuuko lui dit alors quelque chose qu’il n’a jamais su, il était son premier amour, et celui-ci ne semble pas être fini.
La seconde se passe dans le présent, juste après les évènements de ef – A Tale of Memories (donc c’est la suite de cette série).
Kuze Shuuichi rencontre la cousine de Renji Aso, Mizuki Hayama et passe beaucoup de temps avec elle.
Kuze a une maladie incurable et peu de temps à vivre. Il décide donc de briser le silence en avouant son amour à Mizuki.
Mais les choses tournent mal au moment où elle lui dit qu’elle l’aime aussi…