Alors qu’ils devaient passé l’été dans un camp de vacance, sept enfants sont transportés dans un monde virtuel : le Digital World. Dans ce monde réside les Digimon, de petits monstres digitaux se répartissant en trois classe : donnés, virus et anti-virus. Après leur arrivé, les enfants se rendent compte qu’ils ont chacun un digimon chargé de les protéger et de les guider ainsi qu’un digivice, une sorte de petit ordinateur permettant aux digimons d’évoluer.
Taichi, Yamato, Sora, Izumi, Mimi, Joe et Takeru vont alors comprendre qu’il ont été choisis pour aider ce monde dans lequel des digimons de type virus font la loi et bouleverse l’équilibre. Mais la survie s’annonce difficile pour ce groupe d’adolescent qui, de plus, font parfois face à des tensions à l’intérieur même de leur groupe.
